Xử lý nước thải chăn nuôi là việc làm vô cùng cần thiết, bởi vì nước thải chăn nuôi có nồng độ các chất gây ô nhiễm cực cao. Điển hình phải kể đến như Nito và các chất hữu cơ. Những chất này nếu không được xử lý mà thải thẳng ra ngoài môi trường sẽ gây ra hiện tượng phú dưỡng cho nguồn nước, làm ảnh hưởng lớn đến các động thực vật mà nguồn nước này chảy qua.